Situata a metà della strada che da San Vito dei Normanni conduce alla borgata Serranova, in contrada San Nicola-Malpasso, la cripta e le quattro grotte ad essa collegate si trovano in una piccola vallata.
Nella zona dell'antico casale di San Giacomo, già disabitato al tempo di Federico d'Aragona nel 1489, sotto l'antica chiesa, si trova la cripta della Madonna di San Giacomo.